显微镜的光阑和照相机光阑的作用基本一样的，是用来调节进光量的。但具体使用时有一些差别。在室外拍摄时，光的强度是不变的，使用只要光阑大小调节来获取进光量。显微镜由于可以调节灯的亮暗，所以对于进光量来说，是光的亮暗和光阑配合起来调节，以获取最优化的进光量。一般来说光越亮，景深越小。
显微镜中限制物镜光束称为孔径光阑，限制视场(大小)最多的光阑，称为视场光阑。
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